بخش پژوهش براساس هدف و ماموریت خود طرحهای پژوهشیای را تعریف کرده و یا میپذیرد که در راستای توسعه اصیل و ملی باشند. طرحها نیز با مدیریت همفکری مابین متخصصین مربوطه بخصوص با تأکید بر جنبهی چندرشتهای و بینارشتهای پدیدههای انسانی و اجتماعی به شناخت مسایل و راهحلهای ممکن تمرکز میکنند. درحال حاضر پژوهشهای مرکز بر سه حوزهی اندیشهی سیاسی، تاریخ ایران، و حقوق بینالملل متمرکز است. فرایند پژوهش روشمند بوده و جدای از نظارت کارفرما حداقل سه بار کنترل کیفیت بر آن اعمال میشود. از جمله طرحهایی که تا کنون در بخش پژوهش تعریف شدهاند، میتوان به موارد زیر اشاره کرد:
- منشور ملی تنوع فرهنگی و همبستگی اجتماعی
- همیاری
- اسپم